Сулфонирането играе важна роля в областта на съвременната химическа промишленост и е важна стъпка в синтеза на разнообразни органични продукти. Той се използва широко в медицината, пестицидите, горивата, перилните препарати и петролната промишленост. Някои лекарства имат някои проблеми в клиничното приложение поради лошата им разтворимост във вода, като ниска бионаличност, голяма доза, бавна абсорбция на таблетки или капсули. След сулфуниране тези съединения могат не само да повишат тяхната разтворимост във вода, но и да повишат биологичната им активност.